Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb4A2A863 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb4A2A863 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itgb4A2A863 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb4A2A863 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms