Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc1lA2A5N3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1lA2A5N3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms