Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc173A0JLY1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc173A0JLY1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms