Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc112A0AUP1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc112A0AUP1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms