Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap99A0A140LIX9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap99A0A140LIX9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap99A0A140LIX9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap99A0A140LIX9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap99A0A140LIX9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap99A0A140LIX9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cfap99A0A140LIX9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap99A0A140LIX9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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