Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms