Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.31■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms