Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28171A0A087WQ19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms