Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA9

Scgb2b18, ABPBG18, mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b18A0A087WPA9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scgb2b18A0A087WPA9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Scgb2b18A0A087WPA9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Scgb2b18A0A087WPA9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Scgb2b18A0A087WPA9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Scgb2b18A0A087WPA9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Scgb2b18A0A087WPA9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Scgb2b18A0A087WPA9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scgb2b18A0A087WPA9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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