Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28919A0A087WP35 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Gm28919A0A087WP35 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Gm28919A0A087WP35 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Gm28919A0A087WP35 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28919A0A087WP35 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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