Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms