Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv31A0A075B5J5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms