Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm3839S4R1W1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm3839S4R1W1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm3839S4R1W1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm3839S4R1W1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm3839S4R1W1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm3839S4R1W1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3839S4R1W1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms