Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms