Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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