Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk1bQ9Z2C6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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