Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms