Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hmgn5Q9JL35 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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