Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nectin1Q9JKF6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms