Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fndc8Q9D2H8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms