Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms