Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rfc5Q9D0F6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rfc5Q9D0F6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms