Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms