Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubqln4Q99NB8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms