Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms