Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms