Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms