Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms