Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Abcf3Q8K268 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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