Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms