Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms