Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms