Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms