Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms