Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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