Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms