Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms