Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ly6eQ64253 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ly6eQ64253 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ly6eQ64253 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms