Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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