Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms