Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms