Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms