Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epha1Q60750 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms