Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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