Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms