Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms