Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl5Q5DTT4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl5Q5DTT4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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