Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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BB287469Q3UT53 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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BB287469Q3UT53 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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BB287469Q3UT53 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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BB287469Q3UT53 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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BB287469Q3UT53 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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BB287469Q3UT53 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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