Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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