Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms